Кал з унітазу збирати заборонено. Для дослідження потрібно збирати свіжовиділений кал в стерильний одноразовий контейнер для калу в кількості не менше 10─15 г. з трьох різних ділянок спеціальною ложкою, вмонтованою в кришку контейнера.
Матеріал необхідно збирати із останньої порції випорожнень. Для цього аналізу з різних ділянок останньої порції відбирають 10‒ 15 г калу. Кал не має містити сторонніх домішок, наприклад сечі. Кал забирається спеціальної «ложкою», вбудованою в накривку спеціального контейнера.
Пацієнт повинен за три дні до передбачуваного часу взяття зразка калу для аналізу виключити з раціону харчування м'ясо, рибу, помідори, зелені овочі та фрукти такі як яблука, перець, шпинат, квасоля. Відмовитися від прийому медикаментів, які містять у своєму складі залізо та проносних засобів.
Кал, як і сечу, потрібно збирати у стерильний контейнер. Найзручніше придбати такий в аптеці для досліджень калу.
Напередодні забору біоматеріалу потрібно дотримуватися дієти з обмеженням продуктів, що «фарбують» (томатний сік, томати, буряк, шпинат, чорниці тощо).
Збирають кал після ранкової дефекації. Необхідна кількість калу для копрограми – близько чайної ложки, набраної з різних ділянок.